中國科學院生態環境研究中心始建于1975年，前身為經國務院批準成立的中國科學院環境化學研究所。經國家科委和中國科學院批準，1986年與中國科學院生態學研究中心(籌)合并，改為現名。
中心現有在職職工394人，其中科研人員273人，中國科學院院士3人、中國工程院院士4人，研究員60人、副研究員和高級工程師84人、中級研究人員109人。中心有環境科學、環境工程、生態學、環境經濟與環境管理博士學位授予權，有環境科學、環境工程、生態學、環境經濟與環境管理、分析化學、人口資源與環境經濟學、有機化學碩士學位授予權，設有環境科學與工程、生物學博士后流動站，為中國科學院博士生重點培養基地。現有在學博士生372人、碩士生246人，在站博士后研究人員99人。
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